電磁流量計經(jīng)安裝調(diào)試并試運行一段時間后，可進入正常投運階段。因為環(huán)境變化和長時間的運行會對電磁流量計的運行狀態(tài)產(chǎn)生影響，此階段可能發(fā)生的儀表故障與前文所述故障存在差異。一般來講，電磁流量計投運后故障包括流量傳感器內(nèi)壁附著層污垢積聚造成的故障、儀表環(huán)境條件變化造成的故障、雷電打擊等惡劣氣象環(huán)境導(dǎo)致的故障等。
電磁流量計投運后，因常用來測量相對臟污的流體介質(zhì)，運行一段時間后，流體介質(zhì)在傳感器內(nèi)壁附著層出現(xiàn)積聚現(xiàn)象，導(dǎo)致附著層的電導(dǎo)率偏高或偏低進而產(chǎn)生故障。若流體介質(zhì)積聚附著層呈絕緣性，雜質(zhì)積聚過多會造成整個電極回路斷路；相對地，若流體介質(zhì)積聚附著層整體偏導(dǎo)電性，過多地積聚將會使電極回路出現(xiàn)短路。上述兩種情況均會導(dǎo)致儀表工作不正常，由此可見有必要在電磁流量計投運后對測量管內(nèi)的污垢層附著物進行定期清理。
另一方面，電磁流量計運行環(huán)境的變化對儀表的影響也不可忽視。在調(diào)試期間沒有干擾源不意味著運行環(huán)境不存在干擾。例如在電磁流量計運行期間，附近管道的電焊作業(yè)、大型電機或變壓器等電磁設(shè)備運行均會對電磁流量計的正常工作產(chǎn)生干擾，此時電磁流量計的輸出信號會出現(xiàn)數(shù)值波動。
此外，雷電打擊等惡劣氣象環(huán)境同樣能夠影響儀表正常工作。例如出現(xiàn)雷電打擊，儀表線路中容易感應(yīng)出高電壓和浪涌電流，其大多通過電源線、流量信號線等途徑進入儀表進而導(dǎo)致儀表內(nèi)部結(jié)構(gòu)受損。
